Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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