Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SCGB2A2Q13296 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SCGB2A2Q13296 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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