Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPA4Q13156 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RPA4Q13156 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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