Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLFQ13129 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RLFQ13129 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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