Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms