Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTP4A2Q12974 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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