Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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