Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms