Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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