Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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