Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TROQ12816 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TROQ12816 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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