Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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