Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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