Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms