Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms