Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms