Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms