Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms