Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms