Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLTCQ00610 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms