Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK16Q00536 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms