Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM193AP78312 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms