Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PGGT1BP53609 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PGGT1BP53609 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PGGT1BP53609 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PGGT1BP53609 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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