Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms