Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB2P47870 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms