Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms