Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TGFBR1P36897 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms