Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms