Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms