Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-FP30511 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms