Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms