Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSFA2P28290 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms