Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPREP23469 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPREP23469 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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