Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCP2P22307 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCP2P22307 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCP2P22307 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms