Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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