Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRHP20396 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms