Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms