Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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