Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XBP1P17861 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms