Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXB3P14651 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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