Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms