Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RARBP10826 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RARBP10826 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RARBP10826 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms