Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GLI4P10075 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GLI4P10075 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms