Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms