Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXB7P09629 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms