Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH8O95206 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH8O95206 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH8O95206 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms