Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms