Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAB2O43741 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms