Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TO15178 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TO15178 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TO15178 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TO15178 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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