Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms